Fun Lab merupakan laboratorium IPA Taman Pintar Yogyakarta yang memberi pelayanan kepada pengunjung untuk mempraktikkan ilmu sains sesuai dengan kurikulum sekolah. Fun Lab menyediakan layanan Hand On Science (HoS) yang dilaksanakan setiap hari di Lantai 3 Gedung Kotak Taman Pintar. Pengunjung dapat melihat dan melakukan percobaan sains menarik seperti : botol peniup balon, lava timbul tenggelam, hujan warna dalam air juga roket air, tentunya didampingi oleh laboran yang terlatih. Pengunjung dapat pula membawa pulang kit HoS dan melakukan percobaan sendiri di rumah dengan mudah.